Dalam melakukan program layanan bagi Pendidikan Anak Usia Dini, ECCD-RC banyak kerjasama dengan institusi-institusi ,antara lain;
• Direktorat PAUD
• Forum PAUD DIY
• Himpaudi (Himpunan Pendidik Anak Usia Dini)
• LSM :
• Plan International,
• IRD (International Relief & Development),
• Save the Children,
• CCF (Christian Children Fund)
• LSPPA (Lembaga Studi Pengembangan Perempuan dan Anak)
• YEAN (Yayasan Edukasi Anak Nusantara)
• YEU (Yakkum Emergency Unit) Aceh
• Pemerintah:
• Dinas Pendidikan Tingkat Propinsi dan Kota
• Departemen Sosial
• Departemen Agama
• BPKB : Kota Yogya, Kupang, Bantul,
• SKB : Kota Yogya, Gunung kidul, Bantul
• Universitas : UGM, UNY, UAD, UMY
• Forum pendidik
• Yayasan/lembaga pendidikan
• Sekolah-sekolah
• Harian Jogja
• Radio Anak Jogja
• Penerbit Buku
• Produsen media belajar anak
• Forum Perpustakaan Alternatif